То, что масло всё равно грязное, это нормально при частичной замене. Вы с бублика масло не сливали же старое, оно-то само не выливается. Запутался, сейчас коробка какая установлена, с какой машины? Шум доносился из коробки, из бублика или откуда? Опиши шум, глухой, звонкий, тихий, громкий?