Он мог присутствовать и работать, а поставив ХОТЯ БЫ другой экземпляр 003-х мозгов, Вы обломали всю малину. По-хорошему этот новый экземпляр надо шить к тому блоку EWS, который на машине уже есть, делается это на сервисе с помощью диагностических программ.
Или другой вариант - ставить мозги без поддержки EWS и выпиливать полностью его с машины.